Срок хранения документации в AEMP составляет не менее пяти лет. Однако другие законодательные положения, например, касающиеся историй болезни, могут предусматривать иные сроки. Разделы 194 и последующие Гражданского кодекса Германии (BGB) регулируют сроки исковой давности, которые могут составлять от трех до 30 лет в зависимости от требования о возмещении ущерба. Например, документация по искам о возмещении ущерба, причиненного жизни или здоровью, должна храниться до 30 лет.
Десятилетний срок хранения согласно § 630f BGB, который применяется к записям пациентов, также не следует путать со сроком исковой давности. Этот срок начинает течь только после того, как заинтересованное лицо узнает об обстоятельствах, обосновывающих его требование.