De bewaartermijn voor documentatie in het AEMP bedraagt ten minste vijf jaar. Andere wettelijke bepalingen, zoals die met betrekking tot patiëntendossiers, kunnen echter afwijkende termijnen voorschrijven. De artikelen 194 en volgende van het Duitse Burgerlijk Wetboek (BGB) regelen de verjaringstermijnen, die afhankelijk van de schadevordering tussen drie en 30 jaar kunnen bedragen. Zo moet de documentatie van schadevorderingen op grond van letsel aan leven of gezondheid tot 30 jaar worden bewaard.
De bewaartermijn van tien jaar op grond van artikel 630f BGB, die van toepassing is op patiëntendossiers, mag evenmin worden verward met de verjaringstermijn. Deze termijn begint pas te lopen zodra de betrokkene kennis heeft gekregen van de omstandigheden die zijn vordering rechtvaardigen.